Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms