Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC8A2Q9UPR5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms