Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms