Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms