Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMILIN3Q9NT22 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms