Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms