Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PACSIN1Q9BY11 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.4 ms