Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms