Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SH3GL2Q99962 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SH3GL2Q99962 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms