Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT140Q96RY7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms