Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
UBE2E2Q96LR5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms