Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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