Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms