Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT35Q92764 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms