Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACE1Q8IYU2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms