Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms