Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR44Q5JSH3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms