Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D3Q587I9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D3Q587I9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D3Q587I9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SFT2D3Q587I9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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