Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms