Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms