Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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