Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMA3Q16787 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms