Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBR1Q14596 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms