Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTTNQ14247 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms