Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LSAMPQ13449 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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