Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMS2P3Q13401 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms