Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF2Q12933 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms