Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TROQ12816 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TROQ12816 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TROQ12816 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TROQ12816 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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