Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms