Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN1BQ07699 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms