Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CD164Q04900 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CD164Q04900 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CD164Q04900 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CD164Q04900 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CD164Q04900 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms