Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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