Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA2P51531 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms