Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms