Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD1P28340 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms