Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms