Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms