Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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CXCL3P19876 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CXCL3P19876 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CXCL3P19876 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CXCL3P19876 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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