Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms