Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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