Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCNAP12004 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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