Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms