Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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HOXA3O43365 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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