Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRTO14522 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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