Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
A4D1N5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
A4D1N5 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
A4D1N5 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms