Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9Y3F1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.9 ms