Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIF3AQ9Y2N7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIF3AQ9Y2N7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HIF3AQ9Y2N7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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