Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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