Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms