Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms